товарищ - с этого надо было и начинать...
рекомендуется вообще магазин держать в закрытом состоянии пока не доведется до ума, а иначе боты поймут что на нём бедлам и тратить на него свои ресурсы не стоит, и будут заходить раз в пару месяцев, столько же времени и индексировать.
Рекомендую почитать хотя бы базовые пособия по СЕО, особенно поставьте акцент на внутреннюю оптимизацию сайта. Посмотрите также на сайты топовых конкурентов, что у них да как. Скажу сразу,- если Вы решили делать магазин самостоятельно, и хотите чтоб с него был толк, то поработать Вам придётся немало...
насчёт индексации есть эдурилки в каждой поисковой системе - гугл вам найдет их, ну а вообще в панелях вебмастера:
google посмотреть как гуглбот - отправить на индексирование
яндекс переобход страниц
повторюсь - предлагайте к индексированию уже готовый контент, иначе ПС даже эти инструменты станут игнорировать...