Решено. Просто повторно скопировал последний update версий Opencart.pro 2.1.0.2.1., тут как раз было обновление поиска. Помогло, все вернулось в норму.
Поставил также другой модуль поиска "ExtendedSearch - extends the standard search functionality", автор AlexDW. Позволяет поиск по Model, SKU, EAN, JAN, ISBN, MPN, attributes.
Модуль бесплатный: http://www.opencart.com/index.php?route=extension/extension/info&extension_id=22288&filter_search=ExtendedSearch - extends the standard search functionality
Что важно - модуль безотказно работает на Opencart.pro 2.1.0.2.1. Проверено.